1、自然降解：
在自然條件下，聚丙烯酰胺會發生緩慢的物理降解（熱、剪切）、化學降解（水解、氧化以及催化氧化）和生物降解（微生物酶解）。這些降解主要是通過激發產生自由基引起連鎖氧化反應，從而造成聚合物主鏈斷裂和相對分子質量降低，水溶液黏度損失，在對聚丙烯酰胺的穩定性研究發現，聚丙烯酰胺在水溶液中同時發生兩種化學降解反應：
① 水解反應，引起側基結構的變化，由酰胺基轉變為羥基；
② 氧化反應，引起主鏈的斷裂，使聚合物相對分子質量減少。氧化降解反應具有自由基連鎖反應的特征，對過氧化物、還原性有機雜質以及過渡金屬離子等起著活化劑作用，產生活性自由基碎片，促進聚合物氧化降解。聚合物中的過氧化物及產生的羰基化合物是引發聚合物氧化降解和光降解的主要原因。
2、使用過程中發生降解：
聚丙烯酰胺干粉在水中完全溶解一般需要40-90分鐘，這樣分子鏈才能完全伸展開，伸展充分的分子鏈才可以發揮更好的效能。
有時為了加快溶解速度，我們會采用加熱的辦法，溶解聚丙烯酰胺干粉的水溫高，可以加快溶解速度，一般水溫不能超過45℃，聚丙烯酰胺在溫度高于45℃時就會降解，并且隨著溫度的升高降解的越來越快，直至完全失效。
在溶解聚丙烯酰胺時，攪拌速度也會使聚丙烯酰胺溶液發生降解。聚丙烯酰胺是高分子量長分子鏈的聚合物，在污水處理中主要靠較長的分子鏈結構發揮其捕捉廢水中大顆粒懸浮物，使其形成較大的絮團，加快沉降。如果在溶解過程中攪拌速度過快，就會剪斷聚丙烯酰胺的長分子鏈，影響使用效果。
3、與鐵反應發生降解：
聚丙烯酰胺與鐵離子接觸后，會導致其分子量下降，我們稱為“降解”，降解后的聚丙烯酰胺溶液會失去粘稠度，在制香、工業膠水等增稠行業中使用效果較差。
聚丙烯酰胺與鐵離子接觸后，鐵離子中某些物質會導致聚丙烯酰胺—酰胺基團的破壞，使聚丙烯酰胺的分子支鏈斷裂，無法自由延長伸展，在水處理行業中，使用效果會明顯下降。所以在儲存、搬運、溶解和使用過程中，盡量減少聚丙烯酰胺與鐵離子的長時間接觸，以免造成自然降解，分子量下降，導致使用效果差的情況發生。
4、存放運輸過程發生降解：
聚丙烯酰胺長期存放，因為聚合物的緩慢降解，而使得溶液的粘度發生改變。特別是運輸條件比較差是較為明顯的。為此，除了采取措施改善運輸環境外，還需要嚴格控制存放溫度。存放時溫度在50℃以下較好；在戶外應防止陽光的直接暴曬。可在溶液中添加適量的穩定劑，如硫脲、亞硝酸鈉等，以此來保持聚合物水溶劑的穩定性，能更好的達到長期存放的效果，且不會讓粘度下降。
